{"id":12625,"date":"2025-08-10T22:05:05","date_gmt":"2025-08-10T20:05:05","guid":{"rendered":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/?page_id=12625"},"modified":"2025-12-10T22:28:38","modified_gmt":"2025-12-10T20:28:38","slug":"eksoomi-sekveneerimine-ngs","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/parilike-haiguste-ja-riskialleelide-uuringud\/eksoomi-sekveneerimine-ngs\/","title":{"rendered":"Eksoomi sekveneerimine (NGS)"},"content":{"rendered":"\n

Kliinilise geneetika keskus, molekulaardiagnostika labor www.kliinikum.ee\/geneetika<\/a><\/em><\/p>\n\n\n\n

Kuna paljud geneetilised haigused on geneetiliselt heterogeensed (v\u00f5ivad olla p\u00f5hjustatud v\u00e4ga paljude erinevate geenide muutustest) v\u00f5i mittespetsiifilise s\u00fcmptomaatikaga, v\u00f5ivad spetsiifilised \u00fche v\u00f5i paari geeni anal\u00fc\u00fcsid osutuda ebaotstarbekaks. Selliste haiguste puhul (nt isoleeritud vaimse arengu mahaj\u00e4\u00e4mus) on v\u00f5imalik geneetilise anal\u00fc\u00fcsina teostada kogu eksoomi sekveneerimine<\/strong> ehk k\u00f5igi eksonite j\u00e4rjestamine.<\/p>\n\n\n\n

Anal\u00fc\u00fcsi saab teostada kas ainult patsiendile v\u00f5i korraga patsiendile ja tema vanematele (nn trio-anal\u00fc\u00fcs). Trio-anal\u00fc\u00fcs v\u00f5imaldab efektiivsemalt leida haigusp\u00f5hjusi eelk\u00f5ige vaimse arengu mahaj\u00e4\u00e4muse, autismi ja teiste haigusgruppide puhul, kus p\u00f5hjuslike tegurite hulgas on suur uusmutatsioonide (de novo<\/em> mutatsioonide) osakaal. Vastavalt kehtivale tervishoiuteenuste loetelule saab kogu eksoomi sekveneerimist diagnostilise uuringuna tellida vaid vasts\u00fcndinu- ja lapseea ebaselge etioloogiaga haiguste ja s\u00fcndroomide puhul. On n\u00f5utud, et uuringu otsuse on teinud ekspertkomisjon, kuhu kuuluvad raviarst ja meditsiinigeneetik. Ekspertkomisjoni otsuse vorm on leitav geneetikakeskuse kodulehelt eksoomi sekveneerimise saatelehtede juurest.<\/p>\n\n\n\n

Eksoomi sekveneerimise tulemuslikkus kliinilises diagnostikas on 25\u201330%, s.t diagnoos leitakse keskmiselt igale neljandale patsiendile. Kogu eksoomi sekveneerimisega tuvastatakse punktmutatsioone ja v\u00e4ikseid (kuni k\u00fcmne aluspaari suuruseid) insertsioone-deletsioone (nn indeleid). Suuremate indelite ja eksonite\/geenide deletsioonide\/duplikatsioonide (suurusega alates kolmest j\u00e4rjestikkusest eksonist) tuvastamise t\u00f5en\u00e4osus on v\u00e4iksem. Eksoomi sekveneerimisel ei ole v\u00f5imalik tuvastada kromosomaalseid aberratsioone (trisoomiad, translokatsioonid), \u00fcksikute eksonite deletsioone ja duplikatsioone, kordusj\u00e4rjestuste suurenemisest p\u00f5hjustatud haigusi (nt fragiilse X s\u00fcndroom, Huntingtoni t\u00f5bi jt) ega ka reguleerivate alade muutusi v\u00e4ljaspool eksoneid.<\/p>\n\n\n\n

Vastavalt Euroopa Inimesegeneetika \u00dchingu klassifikatsioonile vastab antud anal\u00fc\u00fcs C-t\u00fc\u00fcpi diagnostilisele uuringule, s.t see tugineb \u00fcksnes NGS-metoodikale ja sisaldab katmata alasid eksonites (Eur J Hum Genet. 2016 Jan;24(1):2-5). K\u00f5igi geenide kodeeriv ala kaetakse keskmiselt 95% ulatuses, kuid see v\u00f5ib erineda olenevalt konkreetsest DNA proovist.<\/p>\n\n\n\n

Kuna uuritakse k\u00f5iki geene, on v\u00e4ike v\u00f5imalus, et leitakse ka selliseid muutusi, mis ei ole seotud anal\u00fc\u00fcsi n\u00e4idustuseks olnud seisundiga, kuid mis v\u00f5ivad omada olulist m\u00f5ju patsiendi ja\/v\u00f5i pereliikmete tervisele (nt pahaloomuliste kasvajate riski p\u00f5hjustav geenimuutus). Selliseid leide nimetatakse juhuleidudeks ja need edastatakse raviarstile ainult juhul, kui need esinevad rahvusvaheliselt kokkulepitud juhuleidude nimekirjas, mille on kinnitanud Ameerika Meditsiinigeneetika ja Genoomika Kolleegium (ACMG). ACMG nimekiri sisaldab 57 geeni, mille muutusi seostatakse oluliste p\u00e4rilike terviseriskidega, mille avaldumist on v\u00f5imalik j\u00e4lgimise v\u00f5i raviga v\u00e4hendada (nt p\u00e4rilikud v\u00e4his\u00fcndroomid, kardiom\u00fcopaatiad, r\u00fctmih\u00e4ired jne). Samuti on v\u00f5imalik, et trio-anal\u00fc\u00fcsi korral avastatakse, et tegu pole lapse bioloogilise isa v\u00f5i emaga.<\/p>\n\n\n\n

Eelnevalt kirjeldatud asjaolude t\u00f5ttu on tingimata vajalik patsiendi vanemate hoolikas uuringueelne n\u00f5ustamine ja spetsiaalsete n\u00f5usolekuvormide allkirjastamine. NB! Kui tellitakse trio-anal\u00fc\u00fcs, on vajalik allkirjastada n\u00f5usolek m\u00f5lema vanema poolt.<\/p>\n\n\n\n

K\u00f5ik dokumendivormid ja lisamaterjalid on leitavad aadressilt http:\/\/www.kliinikum.ee\/geneetikakeskus\/saatelehed\/93-saateleht-ja-vajalikud-dokumendid-eksoomi-sekveneerimine-ja-interpretatsioon<\/a><\/p>\n\n\n\n

Uuritav materjal, selle v\u00f5tmine, saatmine ja s\u00e4ilitamine<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Anal\u00fc\u00fcsi tellimisel tuleb koos proovimaterjaliga molekulaardiagnostika laborisse saata ka j\u00e4rgnevad dokumendid:<\/strong><\/p>\n\n\n\n