{"id":13691,"date":"2025-10-14T14:20:14","date_gmt":"2025-10-14T12:20:14","guid":{"rendered":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/?page_id=13691"},"modified":"2025-11-26T21:55:13","modified_gmt":"2025-11-26T19:55:13","slug":"somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/","title":{"rendered":"Somaatilised muutused kasvajakoest (NGS, FFPE)"},"content":{"rendered":"\n<p><em>Geneetika ja personaalmeditsiini kliinik, laboratoorse geneetika osakond, molekulaardiagnostika labor, tel. 731 9487<br><a href=\"http:\/\/www.kliinikum.ee\/geneetika\">www.kliinikum.ee\/geneetika<\/a><\/em><\/p>\n\n\n\n<p><strong>Somaatilisi muutuseid tuumorikoest<\/strong> m\u00e4\u00e4ratakse kasvaja t\u00e4psema diagnostika, haiguse prognoosi v\u00f5i sihtm\u00e4rkravi leidmise eesm\u00e4rgil. Somaatiliste muutuste m\u00e4\u00e4ramiseks kasvajakoest kasutatakse j\u00e4rgmise p\u00f5lvkonna sekveneerimisel (<em>next generation sequencing <\/em>- NGS) p\u00f5hinevat paneelanal\u00fc\u00fcsi Illumina TruSight\u2122 Oncology 500, mis v\u00f5imaldab samaaegselt anal\u00fc\u00fcsida muutusi 523 geenis DNA tasemel ning 1385 geenis RNA tasemel. Anal\u00fc\u00fcsiga on kaetud geenide kodeeriva ala mutatsioonide m\u00e4\u00e4ramine ning amplifikatsioonide ja kogu geeni h\u00f5lmavate deletsioonide m\u00e4\u00e4ramine; RNA p\u00f5histest muutustest m\u00e4\u00e4ratakse fusioone ning splaissingu muutuseid. Eelk\u00f5ige on metoodika m\u00f5eldud muutuste m\u00e4\u00e4ramiseks soliidtuumoritest ning anal\u00fc\u00fcs on disainitud ja optimeeritud formaliinis fikseeritud parafiini sisestatud (FFPE) l\u00f5ikudest eraldatud DNA v\u00f5i RNA anal\u00fc\u00fcsiks.<\/p>\n\n\n\n<p>TruSight\u2122 Oncology 500 on hetkel k\u00f5ige suurema geenide arvuga kommertsiaalselt pakutav paneel, mis v\u00f5imaldab testida somaatilisi muutusi v\u00e4ga erinevates kudedes. Sobivateks kasvajateks on kopsu-, kolorektaal-, rinna-, munasarja- mao-, p\u00f5iekasvajad, samuti saab anal\u00fc\u00fcsida melanoomi, sarkoomide ja muude haruldaste kasvajate korral. &nbsp;NCCN juhendites toodud testimist vajavate geenide nimekirjade j\u00e4rgi on paneeliga kaetud mittev\u00e4ikerakulise kopsuv\u00e4hi, j\u00e4mesoole kasvaja, p\u00e4rasoolekasvaja, melanoomi, rinnav\u00e4hi, neuroendokriinsete kasvajate, emaka ja emakakaela kasvajate, maov\u00e4hi, pankrease adenokartsinoomi seisukohast k\u00f5ik olulised markerid.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-medium-font-size\"><strong>Uuritavad geenid ja muutused<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>V\u00f5imaldab anal\u00fc\u00fcsida samaaegselt kasvajakoe DNA muutusi 523 geenis ning RNA muutusi 1385 geenis. T\u00e4ieliku nimekirja anal\u00fc\u00fcsitavatest geenidest leiab peat\u00fcki l\u00f5pus ning kodulehelt <a href=\"https:\/\/www.kliinikum.ee\/geneetika\">https:\/\/www.kliinikum.ee\/geneetika<\/a>.<\/p>\n\n\n\n<p>Lisaks on anal\u00fc\u00fcsiga v\u00f5imalik m\u00e4\u00e4rata mikrosatelliitide ebastabiilsust (MSI) ning kasvajakoe mutatsioonikoormust (TMB). Mikrosatelliitide ebastabiilsus uuritavas koes viitab DNA valepaardumise reparatsioonis\u00fcsteemi geenide defektile (<em>mismatch repair<\/em> \u2013 MMRd), mis on seotud erinevate pahaloomuliste kasvajate progressiooniga. Samuti on MSI ning TMB farmakogeneetiliseks markeriks teatud immuunoteraapiate korral (PMID: 31151482). Lisaks v\u00f5imaldab anal\u00fc\u00fcs m\u00e4\u00e4rata homoloogse rekombinatsiooni defitsiitsust (HRD).<\/p>\n\n\n\n<p>Geenipaneeli sekveneerimisega tuvastatakse uuritud geenides punktmutatsioone ja v\u00e4ikseid (kuni 10 aluspaari suuruseid) insertsioone-deletsioone (indeleid). Geenipaneeli sekveneerimisega ei ole v\u00f5imalik tuvastada kromosomaalseid aberratsioone (suured deletsioonid ja duplikatsioonid, trisoomiad, translokatsioonid), \u00fcksikute eksonite deletsioone ja duplikatsioone, kordusj\u00e4rjestusi ning \u00fcldjuhul ka reguleerivate alade muutusi v\u00e4ljaspool eksoneid.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-medium-font-size\"><strong>Uuritav materjal, selle v\u00f5tmine, saatmine ja s\u00e4ilitamine<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Uuritavaks materjaliks sobivad FFPE kasvajakoe (algkolle, metastaas, retsidiiv) l\u00f5igud. Soovituslik fikseerimise aeg alla 24h. Elektroonses tellimuses on vajalik m\u00e4rkida saatediagnoos, kasvajamaterjali p\u00e4ritolu, histoloogiline kirjeldus. FFPE proovi saatmisel geneetiliseks uuringuks on vajalik, et patoloog hindaks kasvajarakkude sisalduse antud plokis. LUUMATERJALI KORRAL EI SOBI DEKALTSIFITSEERITUD MATERJAL!<\/p>\n\n\n\n<p>Elektroonse tellimise v\u00f5imaluse puudumisel tuleb koos uuritava materjaliga saata molekulaardiagnostika laborisse ka t\u00e4idetud pabersaatekiri \u2013 Somaatilised muutused tuumorikoest (NGS, FFPE). Saatelehe leiab kodulehelt <a href=\"https:\/\/www.kliinikum.ee\/geneetika\">https:\/\/www.kliinikum.ee\/geneetika<\/a>.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-table is-style-stripes\"><table width=\"100%\"><tbody><tr><td width=\"1%\"><\/td><td width=\"20%\"><strong>Katsuti<\/strong><\/td><td width=\"79%\">Steriilsed 1,5 mL katsutid, 3-5 tk.<\/td><\/tr><tr><td><\/td><td><strong>Anal\u00fc\u00fcsitav kogus<\/strong><\/td><td>FFPE koel\u00f5igud: 2\u00d73 v\u00e4rskelt l\u00f5igatud 10 \u00b5m paksust koel\u00f5iku, 3 l\u00f5iku \u00fches 1,5 mL katsutis. Kasvajarakke peaks materjalis olema \u2265 10%. HRD anal\u00fc\u00fcsiks vajalik kasvajarakkude hulk &gt; 30%.<\/td><\/tr><tr><td><\/td><td><strong>S\u00e4ilivus<\/strong><\/td><td>FFPE koel\u00f5igud: peale parafiinplokist l\u00f5ikude tegemist 3\u20135 \u00f6\u00f6p\u00e4eva. Peale l\u00f5ikude tegemist hoida +4 \u00b0C. Laborisse v\u00f5ib saata toatemperatuuril.<\/td><\/tr><\/tbody><\/table><\/figure>\n\n\n\n<p class=\"has-medium-font-size\"><strong>Anal\u00fc\u00fcsi tegemise aeg: <\/strong>t\u00f6\u00f6p\u00e4eviti, anal\u00fc\u00fcsi valmimisaeg on kuni 6 n\u00e4dalat.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-medium-font-size\"><strong>Anal\u00fc\u00fcsimeetod: <\/strong>j\u00e4rgmise p\u00f5lvkonna sekveneerimistehnoloogia (<em>next generation sequencing<\/em> \u2013 NGS), Illumina TruSight\u2122 Oncology 500.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-medium-font-size\"><strong>Vastuse vorm<\/strong>&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Kasvajakoest tuvastatud muutused ja interpretatsioon ning TMB\/MSI hinnang. HRD anal\u00fc\u00fcsi tellimisel lisaks HRD hinnang ning interpretatsioon.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-medium-font-size\"><strong>N\u00e4idustus&nbsp;<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Soliidtuumorite somaatiliste muutuste m\u00e4\u00e4ramine erinevatest paikmetest (kasvajate diagnostika, sihtm\u00e4rkravi m\u00e4\u00e4ramine).<\/p>\n\n\n\n<p>Koostajad: Kadri Rekker, Kadri Toome, Mikk Tooming<br>Muudetud 01.08.24<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-medium-font-size\"><strong>TruSight Oncology 500 kaetud geenid<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p><strong>\u201e+\u201c Fusioonid (NB! Kaetud vaid juhul, kui on teostatud lisaks DNA anal\u00fc\u00fcsile ka RNA anal\u00fc\u00fcs)<\/strong><\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-table has-small-font-size\"><table width=\"100%\"><tbody><tr><td width=\"1%\"><\/td><td width=\"14%\">ABL1+<br>ABL2<br>ACVR1<br>ACVR1B<br>AKT1<br>AKT2<br>AKT3+<br>ALK+<br>ALOX12B<br>ANKRD11<br>ANKRD26<br>APC<br>AR+<br>ARAF<br>ARFRP1<br>ARID1A<br>ARID1B<br>ARID2<br>ARID5B<br>ASXL1<br>ASXL2<br>ATM<br>ATR<br>ATRX<br>AURKA<br>AURKB<br>AXIN1<br>AXIN2<br>AXL+<br>B2M<br>BAP1<br>BARD1<br>BBC3<br>BCL10<br>BCL2+<br>BCL2L1<br>BCL2L11<br>BCL2L2<br>BCL6<br>BCOR<br>BCORL1<br>BCR<br>BIRC3<br>BLM<br>BMPR1A<br>BRAF+<br>BRCA1+<br>BRCA2+<br>BRD4<br>BRIP1<br>BTG1<br>BTK<br>C11orf30<br>CALR<br>CARD11<br>CASP8<br>CBFB<br>CBL<br>CCND1<br>CCND2<br>CCND3<br>CCNE1<br>CD274<br>CD276<br>CD74<br>CD79A<br>CD79B<br>CDC73<br>CDH1<br>CDK12<br>CDK4+<br>CDK6<br>CDK8<br>CDKN1A<br>CDKN1B<br>CDKN2A<br>CDKN2B<br>CDKN2C<br>CEBPA<br>CENPA<\/td><td width=\"14%\">CHD2<br>CHD4<br>CHEK1<br>CHEK2<br>CIC<br>CREBBP<br>CRKL<br>CRLF2<br>CSF1R+<br>CSF3R<br>CSNK1A1<br>CTCF<br>CTLA4<br>CTNNA1<br>CTNNB1<br>CUL3<br>CUX1<br>CXCR4<br>CYLD<br>DAXX<br>DCUN1D1<br>DDR2<br>DDX41<br>DHX15<br>DICER1<br>DIS3<br>DNAJB1<br>DNMT1<br>DNMT3A<br>DNMT3B<br>DOT1L<br>E2F3<br>EED<br>EGFL7<br>EGFR+<br>EIF1AX<br>EIF4A2<br>EIF4E<br>EML4+<br>EP300<br>EPCAM<br>EPHA3<br>EPHA5<br>EPHA7<br>EPHB1<br>ERBB2+<br>ERBB3<br>ERBB4<br>ERCC1<br>ERCC2<br>ERCC3<br>ERCC4<br>ERCC5<br>ERG+<br>ERRFI1<br>ESR1+<br>ETS1+<br>ETV1+<br>ETV4+<br>ETV5+<br>ETV6<br>EWSR1+<br>EZH2<br>FAM123B<br>FAM175A<br>FAM46C<br>FANCA<br>FANCC<br>FANCD2<br>FANCE<br>FANCF<br>FANCG<br>FANCI<br>FANCL<br>FAS<br>FAT1<br>FBXW7<br>FGF1<br>FGF10<br>FGF14<\/td><td width=\"15%\">FGF19<br>FGF2<br>FGF23<br>FGF3<br>FGF4<br>FGF5<br>FGF6<br>FGF7<br>FGF8<br>FGF9<br>FGFR1+<br>FGFR2+<br>FGFR3+<br>FGFR4+<br>FH<br>FLCN<br>FLI1+<br>FLT1+<br>FLT3+<br>FLT4<br>FOXA1<br>FOXL2<br>FOXO1<br>FOXP1<br>FRS2<br>FUBP1<br>FYN<br>GABRA6<br>GATA1<br>GATA2<br>GATA3<br>GATA4<br>GATA6<br>GEN1<br>GID4<br>GLI1<br>GNA11<br>GNA13<br>GNAQ<br>GNAS<br>GPR124<br>GPS2<br>GREM1<br>GRIN2A<br>GRM3<br>GSK3B<br>H3F3A<br>H3F3B<br>H3F3C<br>HGF<br>HIST1H1C<br>HIST1H2BD<br>HIST1H3A<br>HIST1H3B<br>HIST1H3C<br>HIST1H3D<br>HIST1H3E<br>HIST1H3F<br>HIST1H3G<br>HIST1H3H<br>HIST1H3I<br>HIST1H3J<br>HIST2H3A<br>HIST2H3C<br>HIST2H3D<br>HIST3H3<br>HLAA<br>HLAB<br>HLAC<br>HNF1A<br>HNRNPK<br>HOXB13<br>HRAS<br>HSD3B1<br>HSP90AA1<br>ICOSLG<br>ID3<br>IDH1<br>IDH2<br>IFNGR1<\/td><td width=\"14%\">IGF1<br>IGF1R<br>IGF2<br>IKBKE<br>IKZF1<br>IL10<br>IL7R<br>INHA<br>INHBA<br>INPP4A<br>INPP4B<br>INSR<br>IRF2<br>IRF4<br>IRS1<br>IRS2<br>JAK1<br>JAK2+<br>JAK3<br>JUN<br>KAT6A<br>KDM5A<br>KDM5C<br>KDM6A<br>KDR+<br>KEAP1<br>KEL<br>KIF5B+<br>KIT+<br>KLF4<br>KLHL6<br>KMT2B<br>KMT2C<br>KMT2D<br>KRAS<br>LAMP1<br>LATS1<br>LATS2<br>LMO1<br>LRP1B<br>LYN<br>LZTR1<br>MAGI2<br>MALT1<br>MAP2K1<br>MAP2K2<br>MAP2K4<br>MAP3K1<br>MAP3K13<br>MAP3K14<br>MAP3K4<br>MAPK1<br>MAPK3<br>MAX<br>MCL1<br>MDC1<br>MDM2<br>MDM4<br>MED12<br>MEF2B<br>MEN1<br>MET+<br>MGA<br>MITF<br>MLH1<br>MLL+<br>MLLT3+<br>MPL<br>MRE11A<br>MSH2+<br>MSH3<br>MSH6<br>MST1<br>MST1R<br>MTOR<br>MUTYH<br>MYB<br>MYC+<br>MYCL1<br>MYCN<\/td><td width=\"14%\">MYD88<br>MYOD1<br>NAB2<br>NBN<br>NCOA3<br>NCOR1<br>NEGR1<br>NF1<br>NF2<br>NFE2L2<br>NFKBIA<br>NKX21<br>NKX31<br>NOTCH1+<br>NOTCH2+<br>NOTCH3+<br>NOTCH4<br>NPM1<br>NRAS<br>NRG1+<br>NSD1<br>NTRK1+<br>NTRK2+<br>NTRK3+<br>NUP93<br>NUTM1<br>PAK1<br>PAK3<br>PAK7<br>PALB2<br>PARK2<br>PARP1<br>PAX3+<br>PAX5<br>PAX7+<br>PAX8<br>PBRM1<br>PDCD1<br>PDCD1LG2<br>PDGFRA+<br>PDGFRB+<br>PDK1<br>PDPK1<br>PGR<br>PHF6<br>PHOX2B<br>PIK3C2B<br>PIK3C2G<br>PIK3C3<br>PIK3CA+<br>PIK3CB<br>PIK3CD<br>PIK3CG<br>PIK3R1<br>PIK3R2<br>PIK3R3<br>PIM1<br>PLCG2<br>PLK2<br>PMAIP1<br>PMS1<br>PMS2<br>PNRC1<br>POLD1<br>POLE<br>PPARG+<br>PPM1D<br>PPP2R1A<br>PPP2R2A<br>PPP6C<br>PRDM1<br>PREX2<br>PRKAR1A<br>PRKCI<br>PRKDC<br>PRSS8<br>PTCH1<br>PTEN<br>PTPN11<br>PTPRD<\/td><td width=\"14%\">PTPRS<br>PTPRT<br>QKI<br>RAB35<br>RAC1<br>RAD21<br>RAD50<br>RAD51<br>RAD51B<br>RAD51C<br>RAD51D<br>RAD52<br>RAD54L<br>RAF1+<br>RANBP2<br>RARA<br>RASA1<br>RB1<br>RBM10<br>RECQL4<br>REL<br>RET+<br>RFWD2<br>RHEB<br>RHOA<br>RICTOR<br>RIT1<br>RNF43<br>ROS1+<br>RPS6KA4<br>RPS6KB1+<br>RPS6KB2<br>RPTOR<br>RUNX1<br>RUNX1T1<br>RYBP<br>SDHA<br>SDHAF2<br>SDHB<br>SDHC<br>SDHD<br>SETBP1<br>SETD2<br>SF3B1<br>SH2B3<br>SH2D1A<br>SHQ1<br>SLIT2<br>SLX4<br>SMAD2<br>SMAD3<br>SMAD4<br>SMARCA4<br>SMARCB1<br>SMARCD1<br>SMC1A<br>SMC3<br>SMO<br>SNCAIP<br>SOCS1<br>SOX10<br>SOX17<br>SOX2<br>SOX9<br>SPEN<br>SPOP<br>SPTA1<br>SRC<br>SRSF2<br>STAG1<br>STAG2<br>STAT3<br>STAT4<br>STAT5A<br>STAT5B<br>STK11<br>STK40<br>SUFU<br>SUZ12<br>SYK<\/td><td width=\"14%\">TAF1<br>TBX3<br>TCEB1<br>TCF3<br>TCF7L2<br>TERC<br>TERT<br>TET1<br>TET2<br>TFE3<br>TFRC<br>TGFBR1<br>TGFBR2<br>TMEM127<br>TMPRSS2+<br>TNFAIP3<br>TNFRSF14<br>TOP1<br>TOP2A<br>TP53<br>TP63<br>TRAF2<br>TRAF7<br>TSC1<br>TSC2<br>TSHR<br>U2AF1<br>VEGFA<br>VHL<br>VTCN1<br>WISP3<br>WT1<br>XIAP<br>XPO1<br>XRCC2<br>YAP1<br>YES1<br>ZBTB2<br>ZBTB7A<br>ZFHX3<br>ZNF217<br>ZNF703<br>ZRSR2<\/td><\/tr><\/tbody><\/table><\/figure>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Geneetika ja personaalmeditsiini kliinik, laboratoorse geneetika osakond, molekulaardiagnostika labor, tel. 731 9487www.kliinikum.ee\/geneetika Somaatilisi muutuseid tuumorikoest m\u00e4\u00e4ratakse kasvaja t\u00e4psema diagnostika, haiguse prognoosi v\u00f5i sihtm\u00e4rkravi leidmise eesm\u00e4rgil. Somaatiliste muutuste m\u00e4\u00e4ramiseks kasvajakoest kasutatakse j\u00e4rgmise p\u00f5lvkonna sekveneerimisel (next generation sequencing - NGS) p\u00f5hinevat paneelanal\u00fc\u00fcsi Illumina TruSight\u2122 Oncology 500, mis v\u00f5imaldab samaaegselt anal\u00fc\u00fcsida muutusi 523 geenis DNA tasemel ning 1385 [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":38,"featured_media":0,"parent":7280,"menu_order":19,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"_uag_custom_page_level_css":"","footnotes":""},"class_list":["post-13691","page","type-page","status-publish","hentry"],"acf":[],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v27.3 - https:\/\/yoast.com\/product\/yoast-seo-wordpress\/ -->\n<title>Somaatilised muutused kasvajakoest (NGS, FFPE) - \u00dchendlabor<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"et_EE\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Somaatilised muutused kasvajakoest (NGS, FFPE) - \u00dchendlabor\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"Geneetika ja personaalmeditsiini kliinik, laboratoorse geneetika osakond, molekulaardiagnostika labor, tel. 731 9487www.kliinikum.ee\/geneetika Somaatilisi muutuseid tuumorikoest m\u00e4\u00e4ratakse kasvaja t\u00e4psema diagnostika, haiguse prognoosi v\u00f5i sihtm\u00e4rkravi leidmise eesm\u00e4rgil. Somaatiliste muutuste m\u00e4\u00e4ramiseks kasvajakoest kasutatakse j\u00e4rgmise p\u00f5lvkonna sekveneerimisel (next generation sequencing - NGS) p\u00f5hinevat paneelanal\u00fc\u00fcsi Illumina TruSight\u2122 Oncology 500, mis v\u00f5imaldab samaaegselt anal\u00fc\u00fcsida muutusi 523 geenis DNA tasemel ning 1385 [&hellip;]\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"\u00dchendlabor\" \/>\n<meta property=\"article:modified_time\" content=\"2025-11-26T19:55:13+00:00\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Est. reading time\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"6 minutit\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\\\/\\\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/kasiraamat\\\/kasvajamarkerite-uuringud\\\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\\\/\",\"url\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/kasiraamat\\\/kasvajamarkerite-uuringud\\\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\\\/\",\"name\":\"Somaatilised muutused kasvajakoest (NGS, FFPE) - \u00dchendlabor\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/#website\"},\"datePublished\":\"2025-10-14T12:20:14+00:00\",\"dateModified\":\"2025-11-26T19:55:13+00:00\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/kasiraamat\\\/kasvajamarkerite-uuringud\\\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\\\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"et\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/kasiraamat\\\/kasvajamarkerite-uuringud\\\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\\\/\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/kasiraamat\\\/kasvajamarkerite-uuringud\\\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\\\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Home\",\"item\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"K\u00e4siraamat\",\"item\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/kasiraamat\\\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":3,\"name\":\"Kasvajamarkerite uuringud\",\"item\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/kasiraamat\\\/kasvajamarkerite-uuringud\\\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":4,\"name\":\"Somaatilised muutused kasvajakoest (NGS, FFPE)\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/#website\",\"url\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/\",\"name\":\"\u00dchendlabor\",\"description\":\"Hoolivus, Uuendusmeelsus, P\u00e4devus ja Usaldusv\u00e4\u00e4rsus\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\\\/\\\/www.kliinikum.ee\\\/yhendlabor\\\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"et\"}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Somaatilised muutused kasvajakoest (NGS, FFPE) - \u00dchendlabor","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/","og_locale":"et_EE","og_type":"article","og_title":"Somaatilised muutused kasvajakoest (NGS, FFPE) - \u00dchendlabor","og_description":"Geneetika ja personaalmeditsiini kliinik, laboratoorse geneetika osakond, molekulaardiagnostika labor, tel. 731 9487www.kliinikum.ee\/geneetika Somaatilisi muutuseid tuumorikoest m\u00e4\u00e4ratakse kasvaja t\u00e4psema diagnostika, haiguse prognoosi v\u00f5i sihtm\u00e4rkravi leidmise eesm\u00e4rgil. Somaatiliste muutuste m\u00e4\u00e4ramiseks kasvajakoest kasutatakse j\u00e4rgmise p\u00f5lvkonna sekveneerimisel (next generation sequencing - NGS) p\u00f5hinevat paneelanal\u00fc\u00fcsi Illumina TruSight\u2122 Oncology 500, mis v\u00f5imaldab samaaegselt anal\u00fc\u00fcsida muutusi 523 geenis DNA tasemel ning 1385 [&hellip;]","og_url":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/","og_site_name":"\u00dchendlabor","article_modified_time":"2025-11-26T19:55:13+00:00","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Est. reading time":"6 minutit"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/","url":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/","name":"Somaatilised muutused kasvajakoest (NGS, FFPE) - \u00dchendlabor","isPartOf":{"@id":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/#website"},"datePublished":"2025-10-14T12:20:14+00:00","dateModified":"2025-11-26T19:55:13+00:00","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/#breadcrumb"},"inLanguage":"et","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/somaatilised-muutused-kasvajakoest-ngs-ffpe\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Home","item":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"K\u00e4siraamat","item":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/"},{"@type":"ListItem","position":3,"name":"Kasvajamarkerite uuringud","item":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/kasiraamat\/kasvajamarkerite-uuringud\/"},{"@type":"ListItem","position":4,"name":"Somaatilised muutused kasvajakoest (NGS, FFPE)"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/#website","url":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/","name":"\u00dchendlabor","description":"Hoolivus, Uuendusmeelsus, P\u00e4devus ja Usaldusv\u00e4\u00e4rsus","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"et"}]}},"uagb_featured_image_src":{"full":false,"thumbnail":false,"medium":false,"medium_large":false,"large":false,"1536x1536":false,"2048x2048":false},"uagb_author_info":{"display_name":"Kadi Siigur","author_link":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/author\/kadisi\/"},"uagb_comment_info":0,"uagb_excerpt":"Geneetika ja personaalmeditsiini kliinik, laboratoorse geneetika osakond, molekulaardiagnostika labor, tel. 731 9487www.kliinikum.ee\/geneetika Somaatilisi muutuseid tuumorikoest m\u00e4\u00e4ratakse kasvaja t\u00e4psema diagnostika, haiguse prognoosi v\u00f5i sihtm\u00e4rkravi leidmise eesm\u00e4rgil. Somaatiliste muutuste m\u00e4\u00e4ramiseks kasvajakoest kasutatakse j\u00e4rgmise p\u00f5lvkonna sekveneerimisel (next generation sequencing - NGS) p\u00f5hinevat paneelanal\u00fc\u00fcsi Illumina TruSight\u2122 Oncology 500, mis v\u00f5imaldab samaaegselt anal\u00fc\u00fcsida muutusi 523 geenis DNA tasemel ning 1385&hellip;","_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/13691","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/wp-json\/wp\/v2\/users\/38"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=13691"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/13691\/revisions"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/7280"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.kliinikum.ee\/yhendlabor\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=13691"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}