Geneetika ja personaalmeditsiini kliinik, laboratoorse geneetika osakond, tsütogeneetika labor, tel. 731 9496, www.kliinikum.ee/geneetika/
Mitmesuguste hematoloogiliste haiguse puhul on kromosoomide struktuuri- ja arvuanomaaliate esinemine luuüdi rakkudes oluline näitaja nii diagnostikas kui prognoosi hindamisel.
FISH (fluorescence in situ hybridization) kui molekulaar-tsütogeneetiline meetod võimaldab tuvastada muutusi, mis jäävad alla valgusmikroskoobi lahutusvõimet. Peamisteks tsütogeneetilisteks muutusteks on erinevate kromosoomide arvuanomaaliad, kromosoomide vahelised translokatsioonid, kromosoomi osade deletsioonid/duplikatsioonid/amplifikatsioonid ja inversioonid. Teatud kindlad muutused põhjustavad kindla fenotüübiga vähirakkude tekkimist. FISH meetodi puhul märgistatakse uuritavad lookused fluorestsentsmärgistega ja neid saab analüüsida fluorestentsmikroskoobis. Vastavalt märgise spetsiifikale on võimalik tuvastada kõiki eelpool nimetatud muutuste tüüpe.
Hematoloogiliste haiguste korral on oluline tuvastada tekkinud muutused kultiveerimata rakkudes, sest rakukultuuris võib selektiivselt mitteoluline rakuliin „üle kasvada“ ning patoloogiline rakuliin jääda tuvastamata. Vajadusel saab kasutada ka rakukultuuride materjali, eriti kui on tarvis täpsustada karüotüübi analüüsil leitud aberratsioone: täpsustada murrukohti, tuvastada markerkromosoomide päritolu jne. Oluline on, et iga analüüsi jaoks on vaja kindlat FISH-sondi ja iga analüüsiga saab vastuse ainult konkreetse sondi kohta. Hetkel kasutusel olevad FISH-sondid leiab tsütogeneetika labori saatekirjadelt.
Kuna on teada, et erinevate hematoloogiliste haiguste korral on olulised kindlad geneetilised muutused, siis FISH analüüsid on hõlpsamaks käsitlemiseks koondatud paneelidesse.
ALL (äge lümfoblastleukeemia) esmane paneel (FISH)
t(9;22) BCR-ABL1 | t(1;19) TCF3-PBX1 | 1q25 ABL2 muutused | |
t(12;21) ETV6-RUNX1 | t(17;19) TCF3-HLF | 9q34 ABL1 muutused | |
11q23 KMT2A muutused | 8q24 MYC muutused | 5q32 PDGFRB/CSF1R muutused |
KLL (krooniline lümfotsüütleukeemia) paneel (FISH)
del TP53 (17p13) | 12. kromosoomi trisoomia | |
del ATM (11q22) | del DLEU1 (13q14) |
AML (äge müeloidleukeemia) paneel (FISH)
RUNX1-RUNX1T1 t(8;21) | CBFB t(16;16), inv (16) | del 5q (5q31,5q33) | |
11q23 KMT2A muutused | MECOM(EVI1) t(3;3); inv(3)(3q26) | del 7q (7q22,7q36) | |
del TP53 (17p13) | PML-RARa t(15;17) | CREBBP (16p13.3) muutused |
Hulgimüeloomi paneel (FISH)
NB! Analüüs tehakse CD138+ rikastatud materjalil
IGH (14q32) Break | FGFR3/IGH t(4;14) | |
delTP53 (17p13) | MAF/IGH t(14;16) | |
CCND1/IGH t(11;14) | Trisoomiad: D5S23, D5S721 (5p15.2) /CEP 9/CEP 15 | |
CKS1B/CDKN2C 1q amp/1p del |
Lisaks paneelidele on kasutusel ka palju eraldi tellitavaid FISH-sonde. Samuti on võimalik paneelidel olevaid sonde tellida üksikult.
FISH sondide täisnimekiri on leitav:
Uuritav materjal, selle võtmine, saatmine ja säilitamine
Katsuti | LH-katsuti (roheline musta rõngaga kork) | |
Analüüsitav kogus | 2–5 mL luuüdi (piisab ka karüotüübi määramiseks) | |
Säilivus | Ei säilitata! Proov saata võtmise päeval laborisse, äärmisel juhul võib seista toatemperatuuril 12 tundi NB! Hulgimüeloomi diagnoosi korral saata kindlasti esimesel võimalusel laborisse |
Analüüsi tegemise aeg: tööpäeviti, vastuse saamiseks kulub 2–3 nädalat, erandjuhtudel ja eelneval kokkuleppel üks nädal. Juhul, kui analüüsi tegemise käigus selgub lisaanalüüside vajadus, võib vastuse saamise aeg olla ka pikem.
Analüüsimeetod: hübridisatsioonikoha fluorestsentsmärgistamine (fluorescence in situ hybridization, FISH)
Vastuse vorm
Patoloogilise tulemuse korral antakse leiu sõnaline kirjeldus ja patoloogilise muutusega rakkude protsent analüüsitud materjalis.
Näidustus ja kliiniline tähendus
Ägeda või kroonilise lümfoproliferatiivse haiguse kahtlus, luuüdi transplantatsiooni edukuse või haiguse kulu hindamine.
Vt ka: Karüotüüp luuüdist
Koostaja: Pille Tammur
Muudetud 01.07.2024