Geneetika ja personaalmeditsiini kliinik, laboratoorse geneetika osakond, molekulaardiagnostika labor, tel. 731 9487, www.kliinikum.ee/geneetika/
Spinaalne lihasatroofia (spinal muscular atrophy, SMA) on üks sagedasemaid potentsiaalselt letaalseid autosoom-retsessiivseid pärilikke haigusi valgel rassil (1 : 10000 elussünni kohta). SMA-d iseloomustab seljaaju eessarve α-motoneuronite degeneratsioon. Motoneuronid pole võimelised lihasrakke normaalselt innerveerima, tekib vöötlihaste kõhetumine, mis avaldub eelkõige kehatüvel ja jäsemete proksimaalsetes lihastes. SMA fenotüübi eest vastutavad SMN (survival motor neuron) geenid. Geenid paiknevad SMA regioonis (5. kromosoomi piirkonnas 5q13.2) ja esinevad kahe – telomeerse (SMN1, OMIM* 600354) ja tsentromeerse (SMN2, OMIM*601627) – koopiana.
95% SMA patsientidest on deleteerunud osa SMN1 geenist. Haigus pärandub autosoom-retsessiivselt, s.t avaldumiseks peab deletsioon esinema homosügootsena ehk mõlemalt vanemalt päritud SMN1 geenikoopias (alleelis). Harva on SMN1 geenis kirjeldatud ka punktmutatsioone.
Spinaalse lihasatroofia avaldumise aeg ja raskus sõltuvad SMN2 geeni koopiaarvust. Haigus avaldub hiljem ning kergemal kujul, kui SMN2 geeni koopiaid on kolm või enam. 2–3% normaalsetest kromosoomidest sisaldavad kahte SMN1 geeni koopiat. Sellisel juhul on SMA kandluse uuring raskendatud.
Uuritavad muutused
Uuritav materjal, selle võtmine, saatmine ja säilitamine
Elektroonse tellimisvõimaluse puudumisel tuleb koos uuritava materjaliga molekulaardiagnostika laborisse saata tellimisleht – Spinaalne lihasatroofia (SMA). Tellimisleht on leitav aadressilt https://www.kliinikum.ee/geneetika/molekulaardiagnostika
Katsuti | Veri: K2E/K3E-katsuti (lilla kork) Koetükid: steriilne katsuti (1,5 mL või suurem) | |
Analüüsitav kogus | Veri: 2–5 mL | |
Säilivus | Veri +4 °C juures kuni üks nädal. NB! Mitte külmutada! |
Teiste uuringumaterjalide osas konsulteerida geneetika ja personaalmeditsiini kliiniku arstidega. Prenataalse diagnostika puhul on uuritavaks materjaliks amnionirakkude kultuur või koorionikude ning enne uuringumaterjali saatmist tuleb laborile sellest ette teatada.
Prenataalse diagnostika korral tuleb tellida lisauuring välistamaks koorioni- ja amnionirakkude kontaminatsiooni ema materjaliga.
Vt Koorioni- ja amnionirakkude kontaminatsioon ema materjaliga.
Analüüsi tegemise aeg: tööpäeviti, diagnostilise analüüsi valmimisaeg 2 nädalat ning SMA kandluse määramisel kuni 7 nädalat alates laborisse saabumise kuupäevast.
Analüüsimeetod: polümeraasi ahelreaktsioon (PCR), restriktsioonianalüüs;MLPA (multiplex ligation-dependent probe amplification)
Vastuse vorm
Genotüüp ja interpretatsioon.
Näidustus
Spinaalse lihasatroofia kahtlus, prenataalne diagnostika, spinaalse lihasatroofia kandluse uuring.
Koostajad: Elerin Albin, Neeme Tõnisson
Muudetud 08.12.2022