Geneetika ja personaalmeditsiini kliinik, laboratoorse geneetika osakond, tsütogeneetika labor, Tartu, tel. 731 9496; Tallinn, tel. 731 9173, https://www.kliinikum.ee/geneetika/
Interfaasis (periood, kus rakk ei jagune) olevate rakkude FISH (fluorescence in situ hybridization) analüüs on kiirmeetod, millega on võimalik hinnata meid huvitava lookuse või kromosoomi koopiaarvu rakkudes.
Sünnieelses diagnostikas kasutatakse interfaasi FISH analüüsi sagedasemate kromosomaalsete arvuanomaaliate (13., 18., 21., X ja Y kromosoomi arvuanomaaliad) tuvastamiseks.
Interfaasi FISH analüüsi saab teha kultiveerimata rakkudel ja seega kulub vastuse saamiseks vaid 24–72 tundi. Interfaasi FISH analüüs ei anna informatsiooni kogu karüotüübi ega ka struktuurianomaaliate kohta ning seetõttu järgneb antud analüüsile üldjuhul karüotüübi analüüs kultiveeritud amnioni- või koorionirakkudest või otsesest rakumaterjalist eraldatud DNA submikroskoopiline kromosoomiaberratsioonide analüüs.
Sünnijärgselt kasutatakse interfaasi FISH analüüsi suu limaskesta rakkudel juhtudel kui karüotüübi analüüsil verest on tekkinud kahtlus mõne kromosoomi arvulise anomaalia mosaiiksusele ning on vaja hinnata mosaiikse rakuliini osakaalu teistes kudedes.
Uuritav materjal, selle võtmine, saatmine ja säilitamine
Protseduur (amniotsentees või koorioni biopsia) tehakse ultraheli kontrolli all spetsiaalse väljaõppe saanud günekoloogi poolt (amniotsenteesi korral raseduse 15.–17. nädalal ja koorioni biopsia korral 11.–13. nädalal).
Amniotsentees
Proovinõu | 50 mL steriilne koonuspõhjaga katsuti (saab laborist) | |
Analüüsitav kogus | 15–20 mL amnionivedelikku (piisab erinevateks tsüto- ja molekulaargeneetilisteks analüüsideks) | |
Säilivus | Üks ööpäev toatemperatuuril |
NB! Kui amnionivedelikku on vähem kui 10 mL või amnionivedelik on verine, võib analüüsi tegemine olla raskendatud. Probleemide korral võetakse ühendust punkteerinud ja/või saatva arstiga, kes teavitab patsienti.
Koorioni biopsia
Proovinõu | 50 mL steriilne koonuspõhjaga katstui transpordilahusega (saab laborist) | |
Analüüsitav kogus | 20–50 mg koorioni (piisab erinevateks tsüto- ja molekulaargeneetilisteks analüüsideks) | |
Säilivus | Ei säilitata, koematerjali töötlus peab toimuma protseduuriga samal päeval |
NB! Kui biopsiamaterjalis on koorionikude vähem kui 20 mg või materjalis on liialt verehüübeid või teisi kudesid, võib analüüsi tegemine olla raskendatud. Probleemse proovimaterjali korral võetakse ühendust patsiendi raviarstiga.
Suu limaskesta rakud
Proovinõu | Alusklaas | |
Analüüsitav kogus | Limaskesta kaape äigepreparaat | |
Säilivus | Toatemperatuuril üks ööpäev |
Materjal saadakse suu limaskesta kaapel spaatliga.
Protseduuri tegemise aeg: tööpäeviti
Analüüsi tegemise aeg: tööpäeviti, vastavalt vajadusele, vastuse saamise aeg 48–72 tundi
Analüüsimeetod: hübridisatsioonikoha fluorestsentsmärgistamine (fluorescence in situ hybridization, FISH)
Vastuse vorm
Vastuses kirjeldatakse leidu vastavalt rahvusvahelisele inimese tsütogenoomika nomenklatuurile (ISCN 2020) ja lisatakse tõlgendus. Vastuses tuuakse välja, milliste kromosoomide koopiaarvu kohta analüüsiga infot saadi ja kas on tegemist normaalse või patoloogilise leiuga.
Näidustus ja kliiniline tähendus
Sünnieelse analüüsi näidustuseks on loote väga kõrge risk sagedasematele arvulistele kromosoomianomaaliatele ja/või kiirdiagnostika vajadus. Analüüsi vajalikkuse otsustab arst-geneetik või günekoloog.
Üldjuhul järgneb FISH analüüsile interfaasi rakkudest täiendavalt kas kromosoomianalüüs või submikroskoopiline kromosoomiaberratsioonide analüüs.
Vt ka: Karüotüüp amnionivedelikust
Karüotüüp koorionist
Karüotüüp verest
Submikroskoopilised kromosoomiaberratsioonid
Koostaja: Piret Ilisson
Muudetud 12.10.2023