Hoolimata sellest, et apteegist on võimalik tellida sadu erinevaid ravimitootjate poolt tehtud ravimpreparaate ei pruugi nendest kõikide patsientide ravimiseks piisata, mistõttu võib olla vajalik ravimite ekstemporaalne valmistamine. Ekstemporaalset valmistamist kasutatakse peamiselt just nende ravimite puhul, mida tööstuslikult ei toodeta, eriti oluline on see selliste patsientide jaoks, kes on millegipoolest erilised - näiteks lapsed või väga raskelt haiged.

Lisaks on apteegis eraldi osakond steriilsete ravimite aseptiliselt ettevalmistamiseks. Selle tegevuse eesmärgiks võib olla nii patsiendiohutuse tõstmine (väiksem risk mikrobioloogiliseks kontaminatsiooniks, raviannuste täpsus), kui ka töö- ja keskkonnaohutus (ohtlike ravimite käitlemisest tulenevate riskide vähenemine).