Tartu Ülikooli Kliinikumi kirurgiakliiniku koosseisu kuuluv kirurgilise ja günekoloogilise onkoloogia osakond tegeleb pahaloomuliste kasvajate diagnostika ja kirurgilise raviga. Sageli kombineeritakse operatiivne ravi süsteem- ja/või kiiritusraviga võimalikult hea raviefekti saavutamiseks.

Peamised kasvajapaikmed, mille raviga kirurgilise ja günekoloogilise onkoloogia osakond tegeleb:
- seedeorganite kasvajad ja kasvajaeelsed seisundid
- kuse- ja meessuguelundite kasvajad
- nahakasvajad
- kilpnäärme ja teiste endokriinnäärmete kasvajad
- luude- ja pehmekoe kasvajad
- rinnanäärme kasvajad
- günekoloogilised kasvajad

Uroloogiliste (eesnäärme, kusepõie, neeru, testise vähk) kasvajate diagnostika ja kirurgiline ravi toimub uroloogia ja neerusiirdamise osakonnas.

Üldkirurgia ja plastikakirurgia osakonnas teostatakse naha ja nahaaluskoe hea- ja pahaloomuliste kasvajate kirurgilist ravi ja taastavaid operatsioone (näiteks rinnavähi kirurgilise ravi järgselt).