Sarnane transplantaat peremehevastane reaktsioon võib vallandud ka hilisemas perioodid, siis nimetatakse teda krooniliseks. Seda iseloomustabemanati ketendav nahalööve, suu limaskesta kuivus või valulikkus, silmade kuivus, maksafunktsiooni langus, kõhulahtisus, tupe limaskesta kuivus.
Hilisemas siirdamisjärgses perioodis, kui valgete vereliblede arv on juba taastunud ning bakteriaalsete infektsionide oht vähenenud kuid spetsiifilisemad immuunmehhanismid ei ole veel taastunud saavad patsienti ohustama viirus- või seeninfektsioonid. Lõplik immuunsuse taastumine võtab aega kuni kaks aastat.
Varases haiglajärgsel perioodil kuni immuunsupresseeriva ravi lõpuni käivad patsiendid esialgu igal nädalal, hiljem üle nädala kontrollil, kus neilt võetakse vere analüüsid ning hinnatakse nende seisundit.
Komplikatsioonide olemasolul võib osutuda vajalikuks statsionaarne haiglaravi.