- Kliinikud
- Anestesioloogia ja intensiivravi kliinik
- Geneetika ja personaalmeditsiini kliinik
- Hematoloogia-onkoloogia kliinik
- Kirurgiakliinik
- Kopsukliinik
- Kõrvakliinik
- Lastekliinik
- Meestekliinik
- Nahahaiguste kliinik
- Naistekliinik
- Närvikliinik
- Psühhiaatriakliinik
- Radioloogiakliinik
- Silmakliinik
- Sisekliinik
- Spordimeditsiini ja taastusravi kliinik
- Stomatoloogia kliinik
- Südamekliinik
- Ortopeediakliinik
- Teenistused
- Analüüsi- ja kvaliteediteenistus
- Kantselei
- Kommunikatsiooniteenistus
- Õigusteenistus
- Finantsvaldkond
- Hanketeenistus
- Infektsioonikontrolli teenistus
- Informaatikateenistus
- Juhatus: taristu suurprojektide osakond
- Haldusvaldkond
- Müokardiinfarktiregister
- Operatsiooniteenistus
- Patoloogiateenistus
- Patsienditeenistus
- Personaliteenistus
- Teadus-arendusteenistus
- Sisekontrolliteenistus
- Tehnikateenistus
- Toitlustusteenistus
- Transplantatsioonikeskus
- Verekeskus
- Vähikeskus
- Ühendlabor
- Keskused
Keskused
| Harvikhaiguste kompetentsikeskus | L. Puusepa 2 |
| Kaasasündinud südamerikete keskus | L. Puusepa 2 |
| Toitmisravi keskus | L. Puusepa 8 |
| Transplantatsioonikeskus | L. Puusepa 8, tel: 731 8162 |
| Verekeskus | L. Puusepa 8, tel: 731 9362 |
| Vereloome tüvirakkude ja rakuravi keskus | L. Puusepa 8 |
| Vähikeskus | L. Puusepa 8, tel: 731 9667 |